山南脱走

江戸から戻った近藤（香取慎吾）は、留守の間、土方（山本耕史）が隊士を切腹させたことに腹を立てる。しかし、土方は新選組の結束を固めるには法度で縛るしかないとの信念を崩さず、山南（堺雅人）らとの対立を深める。一方、新しく入隊した伊東甲子太郎（谷原章介）は参謀役に就任。だが、土方は伊東が気に入らず、芹沢を暗殺した部屋に住まわせる。その伊東は江戸から数名の新しい隊士を連れてきていたが、実は新選組を利用して尊皇攘夷を実現しようと考えていた。そんな中、土方は新選組が大所帯となったのを機会に、屯所の移転を提案。西本願寺を新たな地に推薦する。山南は由緒ある寺院に武力を持ち込むことに反対するが、伊東がこれを論破。もはや新選組に居場所がないと感じた山南は土方に休暇を願い出る。だが、頭の切れる伊東に対抗するため山南を手もとに置きたい土方はこれを却下。山南は永倉（山口智充）と原田（山本太郎）にだけ胸の内を明かすと、遊郭から明里（鈴木砂羽）を身請けし、新選組を脱走する。